Dodatek mieszkaniowy na pokrycie kosztów zakwaterowania - zwolnienie czy opodatkowanie

Podatnik jest inżynierem budownictwa. Pracuje poza miejscem zamieszkania i poza miejscem siedziby. Od kwietnia 2016 roku pracodawca przyznał mu dodatek mieszkaniowy na pokrycie kosztów zakwaterowania w miejscowości gdzie akurat jest prowadzona budowa. Wysokość miesięcznego dodatku wynosi 900 zł brutto. Zakład pracy całość wypłacanego dodatku opodatkowuje pomijając dyspozycję art. 21 ust1 pkt 19 ustawy o podatku dochodowym od osób fizycznych. Pracownik zwrócił się do zakładu pracy z prośbą o zastosowanie w/w przepisu i wyłączenie z opodatkowania kwoty 500 zł dodatku. Pracodawca odmówił z przyczyn organizacyjnych. Chcąc niejako odzyskać nienależnie zapłacony podatek (8 miesięcy *500 zł *32% = 1.280 zł) podatnik zmniejszył w zeznaniu PIT-37 kwotę dochodu o kwotę 4.000 zł. Powstała różnica pomiędzy przekazanym przez zakład pracy PIT-11 a złożonym zeznanie PIT-37. Urząd Skarbowy stoi na stanowisku, iż pracownik nie ma prawa do zmiany danych wynikających z PIT-11, może natomiast zwrócić się do pracodawcy o jego skorygowanie ponieważ to tylko pracodawcy przysługuje prawo do wyłączenia spod opodatkowania kwoty 500 zł dodatku?